Инструмент, который определяет биологический возраст на основе эпигенетической информации, полученной из образцов мазка со щеки, также является эффективным предсказателем риска смертности, даже при использовании данных из других тканей.
CheekAge — это «эпигенетические часы» — инструмент, который отслеживает мельчайшие изменения в ДНК, называемые маркерами метилирования, для прогнозирования возраста. Эти метки со временем накапливаются в нашем геноме, влияя на то, как наши гены считываются и превращаются в функциональные белки.
Первое поколение эпигенетических часов было направлено на определение хронологического возраста, но позже в них были включены показатели здоровья и образа жизни. Эти модели изучали эпигенетические маркеры в крови. В начале этого года исследователи из компании Tally Health, базирующейся в Нью-Йорке, разработали CheekAge, который анализирует буккальные мазки из полости рта. CheekAge коррелирует с возрастом, статусом курения, индексом массы тела и потреблением алкоголя.
В новом исследовании команда изучила, может ли CheekAge предсказать будущий риск смерти. Он оказался столь же точным, а в некоторых случаях даже более точным, чем другие эпигенетические часы.
Исследователи протестировали CheekAge на наборе данных 1513 человек, родившихся в 1921 и 1936 годах. Их биологические данные записывались на протяжении всей жизни в рамках программы Lothian Birth Cohorts (LBC) Университета Эдинбурга. В рамках исследования были рассмотрены метилированные участки ДНК, где к нуклеотиду цитозина были добавлены метильные группы.
Увеличение показателя CheekAge на одно стандартное отклонение коррелировало с ростом на 21% риска смерти от всех причин.
Данные метилирования в LBC были получены не из слюны, а из образцов крови. Исследователи считают, что высокая точность CheekAge, даже при использовании данных LBC, свидетельствует о том, что маркеры смертности схожи в разных тканях организма.
«Мы также продемонстрировали, что определённые участки метилирования особенно важны для этой корреляции, что раскрывает потенциальные связи между конкретными генами и процессами, связанными с человеческой смертностью, которые отражаются в наших часах», — сказал в своем заявлении Максим Шохирев (Maxim Shokhirev), соавтор исследования и исследователь из Tally Health.
Важные участки включают ген PDZRN4, который действует как супрессор опухолей. Также значительные маркеры метилирования были замечены в гене ALPK2, связанном с раком и здоровьем сердца.
«Было бы интересно определить, влияют ли гены, такие как ALPK2, на продолжительность жизни или здоровье на моделях животных», — добавил доктор Адив Джонсон (Adiv Johnson), также соавтор исследования из Tally Health.
Исследование было опубликовано в журнале Frontiers in Aging.